Installation eines Programms (VMD) unter Fedora

[adun]

Hallo
Ich muss für die Schule ein Programm (VMD) für Molekül Modulationen unter Linux installieren /benutzen. Leider bin ich auf dem Gebiet noch zimlich unerfahren und hoffe auf etwas Hilfe .

Ich benutze Fedora 17.

In der Anleitung steht folgendes.
Das Programm wird nach home entpackt und die configure datei wird geöffnet.
Darin steht, :

Zitat:#Perl 5.x must be in your path, and /usr/bin/env must exist in order
# for this to work correctly.

===========================

also habe ich ActivePerl 5.16 gedownloadet und mit der Konsole gemäs dem Setup in

Code:

/opt/ActivePerl-5.16

installiert. Dabei ist am Ende des Setups folgende Meldung gekommen.:

Code:

ActivePerl has been successfully installed at /opt/ActivePerl-5.16.

Please modify your startup environment by adding:

  /opt/ActivePerl-5.16/site/bin:/opt/ActivePerl-5.16/bin to PATH
  /opt/ActivePerl-5.16/site/man:/opt/ActivePerl-5.16/man to MANPATH

Ich weis nicht genau was das bedeutet, aber in internet haben sie folgendes geraten was ich auch gemacht habe.

Code:

export PATH=$PATH:/opt/ActivePerl-5.16/site/bin:/opt/ActivePerl-5.16/bin

export MANPATH=$MANPATH:/opt/ActivePerl-5.16/site/man:/opt/ActivePerl-5.16/man

===========================

Weiter soll man in der configure datei folgendes editieren:

Code:

# Directory where VMD startup script is installed, should be in users' paths.
$install_bin_dir="/usr/local/bin";

# Directory where VMD files and executables are installed
$install_library_dir="/usr/local/lib/$install_name";

und nun wie folgt aussehen:

Code:

# Directory where VMD startup script is installed, should be in users' paths.
$install_bin_dir="/usr/local/vmd/bin";

# Directory where VMD files and executables are installed
$install_library_dir="/usr/local/vmd/lib/$install_name";

danach soll man folgendes eingeben

Code:

./configure LINUX
cd src
sudo make install

===========================

Und mein Problem.
1.
Bei der Perl installation habe ich alles so gemacht wie oben beschrieben und es traten keine Fehler auf. Aber wenn ich in der Konsole die Perl Version abfragen will mit

Code:

perl -v

kommt folgende Fehlermeldung:

Code:

bash: perl: command not found...

2
VMD installation: Wenn ich alles wie oben mache und am ende

Code:

./configure LINUX

eingebe kommt folgende Fehlermeldung:

Code:

/usr/bin/env: perl: No such file or directory

Kann mir da jemand helfen ? Währe sehr dankbar

[tk1908]

(02.01.2013 14:50)adun schrieb:  Hallo
Ich muss für die Schule ein Programm (VMD) für Molekül Modulationen unter Linux installieren /benutzen. Leider bin ich auf dem Gebiet noch zimlich unerfahren und hoffe auf etwas Hilfe .

Ich benutze Fedora 17.

In der Anleitung steht folgendes.
Das Programm wird nach home entpackt und die configure datei wird geöffnet.
Darin steht, :

Zitat:#Perl 5.x must be in your path, and /usr/bin/env must exist in order
# for this to work correctly.

===========================

also habe ich ActivePerl 5.16 gedownloadet und mit der Konsole gemäs dem Setup in

Code:

/opt/ActivePerl-5.16

installiert. Dabei ist am Ende des Setups folgende Meldung gekommen.:

Code:

ActivePerl has been successfully installed at /opt/ActivePerl-5.16.

Please modify your startup environment by adding:

  /opt/ActivePerl-5.16/site/bin:/opt/ActivePerl-5.16/bin to PATH
  /opt/ActivePerl-5.16/site/man:/opt/ActivePerl-5.16/man to MANPATH

Ich weis nicht genau was das bedeutet, aber in internet haben sie folgendes geraten was ich auch gemacht habe.

Code:

export PATH=$PATH:/opt/ActivePerl-5.16/site/bin:/opt/ActivePerl-5.16/bin

export MANPATH=$MANPATH:/opt/ActivePerl-5.16/site/man:/opt/ActivePerl-5.16/man

===========================

Weiter soll man in der configure datei folgendes editieren:

Code:

# Directory where VMD startup script is installed, should be in users' paths.
$install_bin_dir="/usr/local/bin";

# Directory where VMD files and executables are installed
$install_library_dir="/usr/local/lib/$install_name";

und nun wie folgt aussehen:

Code:

# Directory where VMD startup script is installed, should be in users' paths.
$install_bin_dir="/usr/local/vmd/bin";

# Directory where VMD files and executables are installed
$install_library_dir="/usr/local/vmd/lib/$install_name";

danach soll man folgendes eingeben

Code:

./configure LINUX
cd src
sudo make install

===========================

Und mein Problem.
1.
Bei der Perl installation habe ich alles so gemacht wie oben beschrieben und es traten keine Fehler auf. Aber wenn ich in der Konsole die Perl Version abfragen will mit

Code:

perl -v

kommt folgende Fehlermeldung:

Code:

bash: perl: command not found...

2
VMD installation: Wenn ich alles wie oben mache und am ende

Code:

./configure LINUX

eingebe kommt folgende Fehlermeldung:

Code:

/usr/bin/env: perl: No such file or directory

Kann mir da jemand helfen ? Währe sehr dankbar

Was gibt dir yum install perl?

Es ist eigentlich nicht notwendig perl zu kompilieren

[adun]

Danke für die Antwort.

Habe das eigegeben und die Installation bestätigt. Am Ende kam

Zitat:Installed:
perl.i686 4:5.14.3-218.fc17

Dependency Installed:
perl-Carp.noarch 0:1.22-2.fc17
perl-Module-Pluggable.noarch 1:3.90-218.fc17
perl-PathTools.i686 0:3.33-218.fc17
perl-Pod-Escapes.noarch 1:1.04-218.fc17
perl-Pod-Simple.noarch 1:3.16-218.fc17
perl-Scalar-List-Utils.i686 0:1.25-1.fc17
perl-Socket.i686 0:2.001-1.fc17
perl-libs.i686 4:5.14.3-218.fc17
perl-macros.i686 4:5.14.3-218.fc17 [/code]
perl-threads.i686 0:1.86-2.fc17
perl-threads-shared.i686 0:1.40-2.fc17

Complete!

Jetzt habe ich nochmals

Code:

./configure LINUX

eingegeben und es hat funktioniert ohne Fehlermeldung.
Auch die VMD installation. Danke vielmal für die schnelle Antwort. Hat mir sehr geholfen

[tk1908]

(02.01.2013 15:02)adun schrieb:  Danke für die Antwort.

Habe das eigegeben und die Installation bestätigt. Am Ende kam

Zitat:Installed:
perl.i686 4:5.14.3-218.fc17

Dependency Installed:
perl-Carp.noarch 0:1.22-2.fc17
perl-Module-Pluggable.noarch 1:3.90-218.fc17
perl-PathTools.i686 0:3.33-218.fc17
perl-Pod-Escapes.noarch 1:1.04-218.fc17
perl-Pod-Simple.noarch 1:3.16-218.fc17
perl-Scalar-List-Utils.i686 0:1.25-1.fc17
perl-Socket.i686 0:2.001-1.fc17
perl-libs.i686 4:5.14.3-218.fc17
perl-macros.i686 4:5.14.3-218.fc17 [/code]
perl-threads.i686 0:1.86-2.fc17
perl-threads-shared.i686 0:1.40-2.fc17

Complete!

Jetzt habe ich nochmals

Code:

./configure LINUX

eingegeben und es hat funktioniert ohne Fehlermeldung. Danke vielmal

Kein Ding

Das Programm das du brauchst, läuft das jetzt?

[mrshadowtux]

Wundert mich, dass bei Fedora kein Perl dabei war standardmäßig. Aber naja, hauptsache es funzt nun

[tk1908]

(02.01.2013 15:04)mrshadowtux schrieb:  Wundert mich, dass bei Fedora kein Perl dabei war standardmäßig. Aber naja, hauptsache es funzt nun

Ich hätte jetzt erst gesagt es hängt damit zusammen, dass Fedora (wie auch Debian) vollständig auf freie Software setzt. Allerdings ist Perl ja "frei".

[mrshadowtux]

Also Perl und Python sind ja sonst bei nahezu jeder Distri in der Standardinstallation dabei. Naja, man lernt nie aus, ich habe mit Fedora bisher auch kaum etwas gemacht.

[adun]

(02.01.2013 15:20)mrshadowtux schrieb:  Also Perl und Python sind ja sonst bei nahezu jeder Distri in der Standardinstallation dabei. Naja, man lernt nie aus, ich habe mit Fedora bisher auch kaum etwas gemacht.

Habe ich auch gedacht. Anscheinend fehlen diverse Sachen wenn man Fedora von einer Live-CD aus installiert.

@tk1908. Das Programm VMD lief danach einwandfrei. Lag wirklich nur an Perl